A Shadowrun Chronicles egy taktikai akció-RPG izometrikus 3D-ben, az RPG részre helyezve a hangsúlyt. A játék két fő részből áll: az akciótérképből, ahol egy futócsoport körökre bontva hajtja végre a küldetéseket, és a metajátékból, egy várostérképpel, ahol a lábmunka, a küldetésre való felkészülés, a szoftverek elkészítése és a karakterkezelés zajlik.